Биоинформатик

Центр системной биоинформатики (ЦСБ) является структурным подразделением Томского НИМЦ РАН, созданным для решения наиболее сложных и наукоёмких задач центра, включая разработку мРНК-вакцин, мультиомиксный анализ данных онкологических и кардиоваскулярных заболеваний, цитогеномику с применением технологий секвенирования третьего поколения.
Требуется специалист по анализу данных WES/WGS, включая данные длинных прочтений (LR-WGS), полученных в рамках национальной генетической инициативы «100 000+Я». Позиция предполагает комплексную обработку и интерпретацию порядка 1000 экзомов и полных геномов, интеграцию геномных и эпигеномных данных для решения задач цитогенетики и цитогеномики, а также популяционной и медицинской генетики.
Биоинформатик с опытом анализа WES/WGS данных
Обязанности
• базовый и продвинутый анализ данных WES/WGS и LR-WGS, работа в рамках проектов по поиску патогенетически и клинически-значимых генетических, хромосомных и эпигенетических вариантов, выявление и интерпретация структурных вариантов, хромосомных перестроек и сложных геномных событий
• разработка/применение алгоритмов и инструментов для мультиомиксного анализа, интеграция WES/WGS и LR-WGS с клиническими, цитогенетическими и эпигеномными данными
• разработка, оптимизация и сопровождение воспроизводимых аналитических пайплайнов, автоматизация процесса анализа, написание скриптов на Bash, Python, R, работа с вычислительной инфраструктурой
• предоставление результатов анализа в виде инфографики и письменного отчета
• участие в подготовке научных публикаций и докладов
Требования
• владение инструментами анализа данных WES/WGS (выравнивание, вариант-коллинг, фильтрация и аннотация вариантов)
• понимание принципов выявления структурных вариантов, CNV и хромосомных перестроек
• опыт работы с Linux и командной строкой
• навыки написания скриптов (Bash, Python и/или R)
• чтение научной литературы и технической документации на английском языке
• будет преимуществом опыт работы с LR-WGS, выявления структурных вариантов, работы с эпигеномными данными
Зарплата
• 115 000–130 000 рублей в месяц (до вычета налогов)
• возможность дополнительного дохода при участии в научно-исследовательских работах и грантовых проектах. В настоящее время в центре реализуется грант РНФ по цитогеномике, участие в его выполнении предусматривает дополнительный доход.
Условия
• рабочий график: 5/2, очная работа .
• рабочее место: индивидуальное, полностью оборудованное.
• техническое оснащение: современный мощный компьютер, доступ к вычислительной инфраструктуре и системе хранения данных.